FastA Format
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=BlastHelp
>Chr1 CHROMOSOME dumped from ADB: Jun/20/09 14:53; last updated: 2009-02-02
CCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCTCTGAATCCTTAATCCCTAAATCCCTAAATCTTTAAATCCTACATCCAT
GAATCCCTAAATACCTAATTCCCTAAACCCGAAACCGGTTTCTCTGGTTGAAAATCATTGTGTATATAATGATAATTTT
ATCGTTTTTATGTAATTGCTTATTGTTGTGTGTAGATTTTTTAAAAATATCATTTGAGGTCAATACAAATCCTATTTCT
TGTGGTTTTCTTTCCTTCACTTAGCTATGGATGGTTTATCTTCATTTGTTATATTGGATACAAGCTTTGCTACGATCTA
CATTTGGGAATGTGAGTCTCTTATTGTAACCTTAGGGTTGGTTTATCTCAAGAATCTTATTAATTGTTTGGACTGTTTA
TGTTTGGACATTTATTGTCATTCTTACTCCTTTGTGGAAATGTTTGTTCTATCAATTTATCTTTTGTGGGAAAATTATT
TAGTTGTAGGGATGAAGTCTTTCTTCGTTGTTGTTACGCTTGTCATCTCATCTCTCAATGATATGGGATGGTCCTTTAG
CATTTATTCTGAAGTTCTTCTGCTTGATGATTTTATCCTTAGCCAAAAGGATTGGTGGTTTGAAGACACATCATATCAA
AAAAGCTATCGCCTCGACGATGCTCTATTTCTATCCTTGTAGCACACATTTTGGCACTCAAAAAAGTATTTTTAGATGT
TTGTTTTGCTTCTTTGAAGTAGTTTCTCTTTGCAAAATTCCTCTTTTTTTAGAGTGATTTGGATGATTCAAGACTTCTC
GGTACTGCAAAGTTCTTCCGCCTGATTAATTATCCATTTTACCTTTGTCGTAGATATTAGGTAATCTGTAAGTCAACTC
ATATACAACTCATAATTTAAAATAAAATTATGATCGACACACGTTTACACATAAAATCTGTAAATCAACTCATATACCC
GTTATTCCCACAATCATATGCTTTCTAAAAGCAAAAGTATATGTCAACAATTGGTTATAAATTATTAGAAGTTTTCCAC
TTATGACTTAAGAACTTGTGAAGCAGAAAGTGGCAACACCCCCCACCTCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCAAATTGAGA
AGTCAATTTTATATAATTTAATCAAATAAATAAGTTTATGGTTAAGAGTTTTTTACTCTCTTTATTTTTCTTTTTCTTT
Applications and Tools that use it:
Reference Genome or Transcriptome Sequence used by aligners as a database.
- Bowtie, BWA, etc.
Output of assembly softwares
- Abyss, Velvet, Trinity, AllPaths, etc.